Fly est l'histoire d'un oiseau qui a une aile déformée qui l'empêche de migrer. Abandonné par ses compagnons, il sombre dans le désespoir. Tout change le jour où Pío-Pío apparaît. Ce poussin sans défense lui redonne de la joie et un but dans la vie. Et le destin va peut-être même le pousser à faire des choses dont il ne se sentait pas capable, comme voler.